世界闻名的凯达博士驾驶自制的时间飞船试飞时,意外发现了W宝石和鹦鹉梦梦。W宝石也引来了虎视眈眈的敌人妖尼、格鲁和发沙的觊觎。在这之后,凯达博士带领着助手丹平(太田淑子 配音)和淳子(冈本茉莉 配音)机器人小精灵及鹦鹉梦梦,驾驶着时间飞船游走于历史各个时代寻找W宝石。他们的敌人妖尼一伙也乘着时间飞船跟博士他们抢夺W宝石。在他们的激战中,邪恶的妖尼一伙屡次要释放炸弹把博士他们炸死,但每每失手,炸弹每次都落到他们自己头上。每次辛苦找到的W宝石,不知道为何都会变成普通的石头,可怜的妖尼只能望着星空悲叹......
《时间飞船》故事主线却是相当成熟的,动漫围绕奇幻童话为核心,整体充满了张力和动人的情感力量,配音堪称一绝,影片的设计处理得非常巧妙温暖唯美。画风可爱又温馨,角色设计程度很高,剧情迷人而又充满说服力,特效近乎完美,是一部有着童话般纯真美好的动画片。