小新一家还有风间，妮妮，正男，阿呆一起报名动感超人周年纪念南海之旅，就在动感超人电影的船上首映会上，突然出现了一群粗暴的猴子将大人们都掳走了。春日部防卫队为了救出大人们而出动，小新一行人冒险渡海到南海上的一座荒岛希望可以查出发生了什么事，但本应在船上小葵和小白竟突然出现，小新还发现另一辆古怪的船......

《蜡笔小新之森林里的暴风雨》故事主线造出了完美的视觉效果，动漫围绕成长和找回童真为核心，整体充满了张力和动人的情感力量，配音是这部动画电影成功的关键，影片的设计高端大气上档次。画风色彩浓重，角色设计完全立体，剧情看起来完全不幼稚或者沉闷，特效大片质感，是一部使思想性和艺术性得到充分展示的动画片。