海神的女儿波妞从深海出逃玩耍，却被困在玻璃瓶里冲到岸上，碰巧被住在岸边悬崖的宗介救出，两人因此相识。但是波妞的父亲——魔法师藤本，认为人类世界肮脏丑陋，强行把波妞带回海里。面对父亲的阻挠、席卷小镇的海啸，以及永远失去魔法的威胁，波妞仍然大胆而坚决地决定——要变大人类跟宗介在一起。而承诺要永远保护波妞的宗介，也即将面临新的挑战...

《崖上的波妞 日语》故事主线却是相当完整的，动漫保持一颗纯真的童心为核心，整体充满了对学术的认真劲，配音惟妙惟肖，影片的设计散发着浓浓的法式情调。画风让人惊艳，角色设计造型奇异，剧情吸引人，特效追求奇、趣、美，是一部能让人感受到暖流流入心田的动画片。